1^er janvier: Entrée en vigueur de l’Accord de Libre Échange de l’Amérique du Nord (ALENA) entre les États-Unis, le Canada et le Mexique.

Soulèvement armé zapatiste: L’EZLN occupe plusieurs villes du Chiapas, parmi lesquelles San Cristóbal des Casas, Las Margaritas, Altamirano et Ocosingo. Par le biais de la Première Déclaration de la Jungle Lacandone, elle déclare la guerre au gouvernement fédéral et à son armée et demande liberté, justice et démocratie pour tous les mexicains.

3 janvier: L’EZLN capture comme prisonnier de guerre le général Absalón Domínguez, ex gouverneur de l’état du Chiapas.

10 janvier: Le président Salinas nomme Manuel Camacho Solís, alors Ministre des Affaires Etrangères et auparavant maire de la ville de Mexico, commissaire pour la paix et la réconciliation au Chiapas.

12 janvier: Du fait de la pression exercée par la société civile, le gouvernement décrète un cessez-le-feu unilatéral et annonce son intention de chercher une solution négociée avec les zapatistes. On estime qu’il y a eu entre 145 et 1.000 morts pendant ces dix jours de guerre. Une grande manifestation pour la paix au Chiapas est organisée dans la ville de Mexico.

16 février: L’EZLN libère l’ex gouverneur Absalón Castlelanos. En échange, le gouvernement libère une centaine de prisonniers zapatistes.

21 février-2 mars: Dialogue de paix dans la cathédrale de San Cristóbal des Casas entre les dirigeants de l’EZLN (le sous-commandant Marcos et 18 commandants membres du Comité Clandestin Révolutionnaire Indigène, CCRI), le commissaire pour la paix Manuel Camacho Solís et le médiateur Samuel Ruiz, évêque de San Cristóbal. Le gouvernement présente un document de 34 engagements que l’EZLN accepte de consulter avec ses bases de soutien.

23 mars: Assassinat de Luis Donaldo Colosio, candidat du PRI à la Présidence de la République, à Tijuana, Basse Californie. L’EZLN se déclare en alerte rouge et suspend le processus de consultations.

12 juin: L’EZLN rejette les propositions du gouvernement issues du dialogue de la Cathédrale (98% des zapatistes consultés s’y étant opposés). Manuel Camacho renonce à son poste de commissaire. L’EZLN décide de maintenir le cessez-le-feu et d’ouvrir une étape de dialogue avec la société civile. Par le biais de la Seconde Déclaration de la Jungle Lacandone, elle convoque la Convention Nationale Démocratique.

6-9 août: 6000 représentants d’organisations populaires de tout le Mexique se réunissent à Guadalupe Tepeyac pour prendre part à la Convention Nationale Démocratique dans le premier « Aguascalientes » zapatiste (lieu de rencontre zapatiste avec la société civile).

21 août: Victoire du PRI lors des élections présidentielles. Ernesto Zedillo Ponce de León est ainsi élu.

28 septembre: Assassinat de José Francisco Ruiz Massieu, Secrétaire Général du PRI, à Mexico.

1er décembre: Prise de possession du nouveau président, Ernesto Zedillo.

19 décembre: L’EZLN rompt le siège militaire et occupe pacifiquement 38 villes qu’elle déclare municipalités autonomes et rebelles.

19-20 décembre: Crise financière: dévaluation du peso (40%), suivie d’une récession économique qui conduit à la faillite de milliers d’entreprises et au licenciement de près d’un million de personnes. Le FMI, les États-Unis et d’autres pays décident d’aider le Mexique en lui prêtant près de 50 mille millions de dollars.

24 décembre: L’EZLN et le gouvernement mexicain acceptent comme médiation la Commission Nationale d’Intermédiation présidée par l’évêque Samuel Ruiz.