11 de enero: El EZLN rechaza la contrapropuesta gubernamental y anuncia que no regresará a las mesas de negociaciones hasta que se cumplan los Acuerdos de San Andrés.

16 de febrero: más de 10.000 indígenas zapatistas marchan en San Cristóbal para exigir el cumplimiento de los Acuerdos de San Andrés aceptando la iniciativa de ley de la COCOPA.

14 de marzo: en San Pedro Nixtalucum (municipio de El Bosque), en un despliegue represivo, la policía estatal abate a civiles simpatizantes del EZLN, resultando en 4 muertos, 29 heridos, 27 detenidos y 300 desplazados.

25 de abril: 200 desplazados choles de la zona Norte de Chiapas rompen el cerco de «Paz y Justicia» con la caravana «Wejlel» («Libertad» en la lengua chol) y marchan hacia la capital del estado para reclamar soluciones a la situación en su región. Hacen un plantón de 87 días antes el Palacio de Gobierno sin ser atendidos por el gobierno estatal.

6 de julio: En las elecciones nacionales, el PRI pierde la mayoría absoluta en la Cámara de Diputados. En el D.F., el PRD gana la gobernatura. En Chiapas se registran irregularidades, violencia y un fuerte abstencionismo.

8 de septiembre: 1.111 delegados zapatistas marchan a la ciudad de México para asistir al segundo Congreso Nacional Indígena y exigir el cumplimiento de los Acuerdos de San Andrés. Participan en el Congreso de Fundación del Frente Zapatista de Liberación Nacional.

4 de noviembre: Ataque en contra de los obispos de la diócesis de San Cristóbal de las Casas cerca de Tila, zona Norte de Chiapas.

29 de noviembre: 10 mil indígenas de diversas regiones de Chiapas realizan una marcha en San Cristóbal para exigir el cumplimiento de los Acuerdos de San Andrés.

Fin de noviembre: Más de 4 mil 500 indígenas (de «Las Abejas» y simpatizantes zapatistas) han huido de la violencia en el municipio de Chenalhó.

8 de diciembre: México y la Unión Europea firman un convenio que abrirá el camino para negociar una zona de libre comercio a partir del año próximo.

11 de diciembre: Las autoridades del municipio Chenalhó y del municipio autónomo de Polhó acuerdan poner un alto definitivo a las agresiones entre las partes. Empieza una serie de reuniones, iniciativa que fracasa el 19 de diciembre por desconfianza de ambas partes.

22 de diciembre: Masacre de 45 personas, la mayoría niños y mujeres pertenecientes al grupo civil «Las Abejas», refugiadas en Acteal, municipio de Chenalhó.

Fin de diciembre: Decenas de personas son detenidas acusadas por su presunta participación en la matanza de Acteal, entre ellas un comandante de la Seguridad Pública y el presidente priísta del municipio de Chenalhó. El gobierno mexicano manda a 5 mil soldados más a Chiapas, incluyendo 2 mil a Chenalhó.