7 février 1999: René Juarez Cisneros (du PRI) remporte les élections et devient gouverneur.

22 février 1999: 25.000 personnes organisent une marche vers Acapulco dénonçant la fraude électorale et exigeant une révision de l’élection

14 avril 1999 : des organisations paysannes et sociales, la direction du PRD au Guerrero et la Commission des Droits Humains du Guerrero (CODDEHUM) se manifestent en faveur de la réouverture de l’affaire du massacre de Aguas Blancas.

20 et 21 avril 1999 : des militaires assassinent 2 indigènes mixtèques (l’un d’eux est un enfant), violent 2 femmes mixtèques à Barrio Nuevo San José et tuent un autre indigène dans une communauté voisine, dans la municipalité de Tlacoachistlahuaca, Costa Chica.

2 mai 1999 : les paysans Rodolfo Montiel Flores y Teodoro Cabrera García de ‘l’Organisation des Paysans Écologistes de la Sierra de Petatlán et Coyuca de Catalán’ (Costa Grande) sont arrêtés de façon illégale, torturés et transférés dans des installations militaires. Un processus judiciaire commence contre eux suite à la fabrication de preuves de délits de la part de l’armée mexicaine. Un autre paysan, Salomé Sanchez Ortiz, est exécuté. Un an plus tard, la CNDH émet la recommandation 8/2000 qui signale la violation des droits humains des écologistes : l’armée mexicaine les a torturés, les a obligés à porter des armes et des drogues avant de les photographier ; et elle les a maintenus au secret de façon illégale pendant au moins 2 jours et demi.

3 mai 1999 : l’Organisation Indigène des Peuples Mixtèques et Tlapanèques (OIPMT) de Ayutla (Costa Chica) porte plainte contre les services de santé de l’état suite à la stérilisation forcée d’hommes et de femmes indigènes (des promesses de récompenses, et des menaces de leur retirer leur aide économique s’ils ne se soumettent pas à l’opération).

23 septembre 1999 : l’ERPI attaqua un convoi militaire près de Ayutla : 3 soldats sont blessés.